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基因芯片制造的新動(dòng)力

日期:2025-05-12 13:42
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摘要:慕尼黑——那些需要制作自己的DNA芯片,而不是依賴昂貴的商業(yè)芯片的生物學(xué)家現(xiàn)在能夠更好地DIY工作了,這要?dú)w功于位于柏林的德國(guó)基因組資源中心(RZPD)制造的一組人類DNA克隆。 芯片已經(jīng)日益廣泛地被從事基因表達(dá)研究的科學(xué)家所使用,因?yàn)樾酒軌驇椭麄儽容^癌癥組織和非癌癥組織中數(shù)千個(gè)基因的活性。大多數(shù)商業(yè)芯片系統(tǒng)要包括數(shù)千個(gè)被稱為寡核苷酸的人造核苷酸短序列,這些序列能夠與由活性基因轉(zhuǎn)錄而來(lái)的特殊信使RNA(mRNA)連接。 但許多研究人員選擇利用逆轉(zhuǎn)錄酶,和直接來(lái)自mRNA的互補(bǔ)DNA(cDNA)來(lái)自己制造比較價(jià)廉的芯片。一旦...
慕尼黑——那些需要制作自己的DNA芯片,而不是依賴昂貴的商業(yè)芯片的生物學(xué)家現(xiàn)在能夠更好地DIY工作了,這要?dú)w功于位于柏林的德國(guó)基因組資源中心(RZPD)制造的一組人類DNA克隆。 芯片已經(jīng)日益廣泛地被從事基因表達(dá)研究的科學(xué)家所使用,因?yàn)樾酒軌驇椭麄儽容^癌癥組織和非癌癥組織中數(shù)千個(gè)基因的活性。大多數(shù)商業(yè)芯片系統(tǒng)要包括數(shù)千個(gè)被稱為寡核苷酸的人造核苷酸短序列,這些序列能夠與由活性基因轉(zhuǎn)錄而來(lái)的特殊信使RNA(mRNA)連接。 但許多研究人員選擇利用逆轉(zhuǎn)錄酶,和直接來(lái)自mRNA的互補(bǔ)DNA(cDNA)來(lái)自己制造比較價(jià)廉的芯片。一旦研究人員獲得了一個(gè)DNA庫(kù),他們就能制造cDNA拷貝從而創(chuàng)造出許多芯片。 非盈利性組織——德國(guó)基因組資源中心表示,其人類cDNA組的質(zhì)量要比其他實(shí)驗(yàn)室高,而且經(jīng)過(guò)排列。RZPD的一個(gè)客戶說(shuō),他們利用該中心cDNA克隆制造的芯片要比商業(yè)核苷酸芯片便宜很多。 RZPD的克隆具有許多優(yōu)勢(shì)。每個(gè)克隆經(jīng)過(guò)反復(fù)測(cè)序和校驗(yàn)。而在大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室中大約有10%-20%樣本的標(biāo)注不正確。RZPD還確保每個(gè)cDNA都代表了一個(gè)獨(dú)特的基因,而大多數(shù)cDNA實(shí)驗(yàn)室往往包含特殊活性基因mRNA的多個(gè)拷貝。 Brigham的基因芯片中心的主任Steven Gullans說(shuō):“一個(gè)序列經(jīng)驗(yàn)證、非隨機(jī)cDNA庫(kù)對(duì)依靠高質(zhì)量試劑進(jìn)行生物學(xué)研究的人員來(lái)說(shuō)簡(jiǎn)直是一個(gè)奇跡。” RZPD的克隆組包含32000個(gè)基因,另外10000個(gè)將在未來(lái)幾個(gè)月中陸續(xù)加入——使其比其他基因庫(kù)擁有更多的基因。G?ttingen大學(xué)的生物化學(xué)家Jobst Landgrebe說(shuō):“將40000個(gè)左右的cDNA點(diǎn)上芯片就意味著我們能覆蓋絕大多數(shù)人類基因組?!彼a(bǔ)充說(shuō)從這個(gè)cDNA組制造芯片的價(jià)格不超過(guò)75歐元。

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